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在風之街「風都」,左翔太郎/搭檔菲利普以及鳴海亞樹子這3人經營著偵探事務所。看似一片何邪的風都背後,神秘組織在地下流通著能讓普通人變成Dopant（怪人）的「惡之蓋亞存儲條／悪のガイアメモリ」。而造成衆多驚奇事件的神秘組織核心「園咲家」的每個人,都在風都有著很大的影響力。挑戰Dopant們引發的奇怪事件的翔太郎和菲利普兩人,使用6根「蓋亞存儲條／ガイアメモリ」合體變身成假面騎士W,毅然決然地對抗著園咲家族。這個家族的目的到底是什麽？另外假面騎士W、菲利浦神秘的過去又是什麽？孕育著衆多謎題,假面騎士W的戰鬥拉開帷幕——。


左翔太郎＝假面騎士W

本篇的主人公。被70年代風格給感化了的自稱「hard-boiled (成熟老練)」的行動派偵探，
但和實際則完全不同是個「half-boiled (半熟君XD)」。
持有著「Joker」等蓋亞存儲條，與搭檔菲利普一起變身成假面騎士W。

菲利普＝假面騎士W

故事的另一個主人公。腦内堆滿了衆多知識的魔少年，
並從自稱爲「地球書架」的大腦圖書館内得到各種各樣的情報。
持有著「颶風」等蓋亞存儲條，與翔太郎一起變身成假面騎士W。

鳴海亞樹子

故事的女主人公。擔任翔太郎和菲利普這對偵探搭檔所屬的偵探事務所的所長。
原先本是父親・鳴海壮吉的偵探事務所，但被翔太郎的活躍所吸引，毛遂自薦頂替音訊不明的父親擔任所長。
厭惡黑白不明的事物，且經常做出離奇的行動。

園咲琉兵衛

操縱著「風都」背後的敵人組織「園咲家族」的教父。
以琉兵衛爲頂點構成的家族，其目的依然是謎。
另外家族各自擁有特殊的蓋亞存儲條，變身成幹部怪人。